Занимая в 2004-2006 годах должность руководителя группы советников по внешней политике Президента Литвы Валдаса Адамкуса, а в 2007-2012 годах — Посла Литвы в Беларуси, Эдминас Багдонас последовательно оказывал поддержку ЕГУ на самых ранних этапах воссоздания деятельности белорусского университета в изгнании в Вильнюсе. Благодаря активному содействию Посла Эдминаса Багдонаса, сотни студентов, преподавателей и сотрудников ЕГУ получали максимально оперативную и регулярную визовую поддержку.
Особенное лидерство Посол Эдминас Багдонас проявил 21 января 2011 года, когда, осуждая нарушения избирательных прав на выборах 19 декабря 2010 года в Беларуси, представители двенадцати диппредставительств и поверенный в делах Делегации ЕС в Беларуси в день инаугурации Александра Лукашенко посетили ЕГУ и обсудили с сообществом университета нарушения прав человека в Беларуси. При непосредственной поддержке Посла Эдминаса Багдонаса в Посольстве Литвы в Беларуси впервые состоялся День встречи выпускников ЕГУ в 2011 году, что положило начало традиции проведения ежегодных EHU Alumni Homecoming.
Посол Эдминас Багдонас скончался в возрасте 57 лет, будучи Послом Литвы в Объединённых Арабских Эмиратах. Университетское сообщество скорбит вместе с близкими и коллегами Посла Эдминаса Багдонаса и выражает искренние слова поддержки.
