Управляющий совет является стратегическим органом управления ЕГУ. Управляющий совет ЕГУ является ответственным за стратегическое руководство, финансирование и эффективную деятельность университета.
Управляющий совет ЕГУ в следующем составе был утверждён сроком на 3 года начиная с 14 декабря 2016 г.:
Председатель Пер Карлсен (Дания)
Бывший посол Дании в Латвии
Заместитель председателя Ева Срейбер (Швеция)
Бывшая вице-президент Европейского инвестиционного банка
акад. Анатолий Михайлов, ex officio (Беларусь)
Президент Европейского гуманитарного университета
проф. Сергей Игнатов, ex officio (Болгария)
Ректор Европейского гуманитарного университета
проф. Людгер Кюнхардт (Германия)
Руководитель Центра исследований европейской интеграции, Университет Бонна
проф. Майкл Кеннеди (США)
Профессор социологии, международных и публичных исследований, Брауновский университет
Миндаугас Качераускис (Литва)Советник Департамента развивающего сотрудничества МИД Литвы
Артём Анисимов (Беларусь)
Выпускник ЕГУ, Адвокат в области космического права в компании Noosphere Ventures